MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 5353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	GCTT	2	8	23	30	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008601	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008601	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008601	T	6	6	136	141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008601	TAA	2	6	2762	2767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008601	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008601	T	6	6	4071	4076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008601	T	6	6	4100	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008601	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008601	T	6	6	4128	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008601	A	6	6	4134	4139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008601	TA	3	6	4154	4159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008601	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008601	ATT	2	6	4183	4188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008601	ATA	2	6	4205	4210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008601	TAT	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008601	TAT	2	6	5822	5827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008601	ATT	2	6	7314	7319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008601	AT	3	6	7320	7325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008601	A	6	6	7337	7342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008601	AAAT	2	8	7348	7355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008601	AAT	2	6	7759	7764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008601	A	7	7	8685	8691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008601	GTT	2	6	8692	8697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008601	TA	3	6	8699	8704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008601	T	6	6	8707	8712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008601	A	6	6	8716	8721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008601	TTTAG	2	10	8746	8755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008601	TAA	2	6	8979	8984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008601	T	6	6	9002	9007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008601	ATT	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008601	TTTA	2	8	9020	9027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008601	T	6	6	9037	9042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008601	GTA	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008601	T	6	6	9140	9145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008601	ATA	2	6	9156	9161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008601	TTA	2	6	9173	9178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008601	ATA	2	6	9184	9189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008601	ATT	3	9	9201	9209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008601	T	6	6	9215	9220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008601	GCG	2	6	9226	9231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008601	TTTA	2	8	9258	9265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008601	AAT	2	6	9320	9325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008601	TAT	2	6	9358	9363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008601	TAA	2	6	9812	9817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008601	T	6	6	9884	9889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008601	CAAC	2	8	9903	9910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008601	AT	3	6	9941	9946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008601	AC	3	6	9974	9979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008601	TAT	2	6	10002	10007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008601	TAG	2	6	10033	10038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008601	TGTA	2	8	10471	10478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008601	GTTA	2	8	10488	10495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008601	ATG	2	6	10517	10522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008601	CA	3	6	10584	10589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008601	TTTA	2	8	10600	10607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008601	TGG	2	6	10619	10624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008601	GTTG	2	8	10638	10645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008601	TTA	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008601	TTG	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008601	TGT	2	6	10780	10785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008601	AT	4	8	10811	10818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008601	TGT	2	6	10843	10848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008601	AATA	2	8	10875	10882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008601	CAA	2	6	10926	10931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008601	TGC	2	6	12960	12965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008601	CTG	2	6	12995	13000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008601	AGT	2	6	13007	13012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008601	ATA	2	6	13034	13039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008601	AT	4	8	13047	13054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008601	A	8	8	13087	13094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008601	A	6	6	15048	15053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008601	TTG	2	6	15105	15110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008601	TGA	2	6	15116	15121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008601	TA	3	6	15125	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008601	TTG	2	6	15179	15184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008601	TGG	2	6	15206	15211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008601	GGC	2	6	15213	15218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008601	TAGCT	2	10	15288	15297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008601	AAGA	2	8	15414	15421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008601	TTA	2	6	15446	15451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008601	CAG	2	6	15476	15481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008601	T	6	6	15516	15521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008601	TTA	2	6	15530	15535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008601	TTA	2	6	15551	15556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008601	TTA	2	6	15651	15656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008601	TAAA	2	8	16919	16926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008601	A	7	7	16924	16930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008601	TAAT	2	8	16981	16988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008601	AGA	2	6	17005	17010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008601	A	6	6	17018	17023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008601	TATT	2	8	17996	18003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008601	GGT	2	6	18021	18026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008601	AT	3	6	18110	18115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008601	AAC	2	6	22578	22583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008601	TGA	2	6	22591	22596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008601	GAA	2	6	22606	22611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008601	A	6	6	22610	22615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008601	T	6	6	22630	22635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008601	T	6	6	22644	22649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008601	T	7	7	22710	22716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008601	T	6	6	22792	22797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008601	AT	4	8	22832	22839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008601	T	7	7	22855	22861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008601	TA	4	8	22897	22904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008601	T	6	6	22937	22942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008601	AT	3	6	22952	22957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008601	ATTA	2	8	22962	22969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008601	TTGT	2	8	24750	24757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008601	TTA	2	6	24767	24772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008601	ACTA	2	8	24773	24780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008601	TAC	2	6	24835	24840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008601	AGG	2	6	24869	24874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008601	TTA	2	6	26804	26809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008601	ATT	2	6	26812	26817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008601	TAAA	2	8	26849	26856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008601	A	7	7	26854	26860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008601	CTT	2	6	26864	26869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008601	ATTT	2	8	26882	26889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008601	CTA	2	6	26894	26899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008601	ATTT	2	8	26936	26943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008601	TC	3	6	26949	26954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008601	ATTG	2	8	26965	26972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008601	AAT	2	6	27067	27072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008601	TATT	2	8	27335	27342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008601	A	6	6	27381	27386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008601	AGT	2	6	27425	27430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008601	ATA	2	6	27484	27489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008601	CAG	2	6	27559	27564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008601	ACT	2	6	27698	27703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008601	GCTT	2	8	27925	27932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008601	ATAAGT	2	12	28010	28021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008601	ATA	2	6	28029	28034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008601	GCTA	2	8	28684	28691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008601	TGT	2	6	30727	30732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008601	TTAT	2	8	30733	30740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008601	TA	4	8	31255	31262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008601	A	7	7	31284	31290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008601	TA	3	6	32898	32903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008601	CTG	2	6	32930	32935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008601	CAAA	2	8	32940	32947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008601	AAT	2	6	32954	32959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008601	TAA	2	6	33529	33534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008601	AGA	2	6	33544	33549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008601	CAA	2	6	33562	33567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008601	ACCT	2	8	36957	36964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008601	AT	3	6	36984	36989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008601	ATA	3	9	37011	37019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008601	AGTT	2	8	37048	37055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008601	T	7	7	37071	37077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008601	A	6	6	37090	37095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_008601	AT	3	6	38632	38637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008601	T	7	7	38643	38649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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